管理处针对保护区全域开展巡查工作，以乘车加徒步结合方式沿长江沿岸进行巡查，主要打击非法捕捞、垂钓及违规建设等违法行为，维护相关法律法规，使保护区生态环境及渔业资源得到有效保护。

对巡查发现的符合行政处罚的行为，立即移交渔政、海事、港航等部门处理，做好巡查工作记录。巡查结束后将信息进行汇总，发现违法违规问题将移交相关部门进行查处。